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Origin入门教程(十九):绘制热图

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发表时间:2020-09-30 15:19作者:铄思百检测来源:铄思百检测

热图作为生物信息中一种常用的数据表现方法,可以简单地汇聚大量数据,同时可使用一种相对应的渐变颜色来展示数据。这种方法可以很直观地呈现空间数据的疏密程度或频率高低。

常见绘制热图的方法有很多,如可用R包,OmicSare tools的热图工具,Heml等绘制。那么如何利用Origin绘制热图呢?让我们来一起学习一下吧~


01

导入数据

把数据输入到originsheet中;26个英文字母为26行,每一列的名称以数字1~26命名(数据为随机输入)

Origin入门教程(十九):绘制热图


02

绘制热图

选中全部数据;点击Plot;③点击Heatmap图标的▼;选择Heatmap with labels(与Heatmap的区别为有无labels,labels可以在后续的设置中更改)

Origin入门教程(十九):绘制热图


弹出Plotting: plotvm对话框,Data Layout 可以根据自己的需要选择用X轴或Y轴表示,本文选择Y across columns。其他参数一般默认即可。

Origin入门教程(十九):绘制热图


示例图:可以看到选择Y across columns,Long name 为Y轴。

Origin入门教程(十九):绘制热图


03

美化

(1)调整图形尺寸:双击图形,弹出Plot Details对话框,在对话框左侧选择Layer 1,点击对话框右侧Size/Speed按钮,对图形的尺寸进行更改;

Origin入门教程(十九):如何利用Origin绘制热图


Origin入门教程(十九):绘制热图


(2)更改Lables:双击图形,弹出Plot Details对话框,在对话框左侧选择Sheet 1,点击对话框右侧Lable按钮;

  • 不勾选Enable,则在热图中无Labels。

Origin入门教程(十九):绘制热图


  • 勾选Enable,则显示labels,并且可以对Labels的字体、字号、旋转角度以及颜色等特征进行设置;

(3)更改填充颜色:双击图形,弹出Plot Details对话框,在对话框左侧选择Sheet 1,点击对话框右侧Colormap按钮,点击Fill后弹出对话框,以3-Color Limiting Mixing为例,设置中间色为Yellow。点击OK并应用,可以看到如下效果图:

Origin入门教程(十九):绘制热图


Origin入门教程(十九):绘制热图


其他选项大家可以自己挖掘一下!

例如在Load Palette中有很多系统自带的配色可供选择。

Origin入门教程(十九):绘制热图


(4)颜色刻度值和范围:双击图形,弹出Plot Details对话框,在对话框左侧选择Sheet 1,点击对话框右侧Colormap按钮,点击Level后弹出对话框。热值范围1~51,Major Levels默认5,为主刻度数。Minor Levels默认5,为中间插入的颜色数量,若改变Minor Levels会使得颜色渐变条更光滑。

Origin入门教程(十九):绘制热图


比如Minor Levels设置200,Total也会随之改变。

Origin入门教程(十九):绘制热图


下图分别是Minor Levels为5和200的热图,可以明显的看出Minor Levels为200的热图颜色渐变条更光滑更自然。

Origin入门教程(十九):绘制热图


Origin入门教程(十九):绘制热图


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